2024年9月4日23時（北京時間），MK体育平台公共衛生學院、上海市重大傳染病和生物安全研究院粟碩團隊與合作者在《自然》（Nature）雜誌發表題為“Farmed fur animals harbor viruses with zoonotic spillover potential”的研究性論文，應用前沿交叉研究方法揭示多種養殖哺乳動物中的高分辨率病毒基因組序列組成、潛在跨物種傳播風險和生態學特征，將為構建多維度公共衛生風險評估與新發傳染病預測預報體系提供數據支持。《自然》雜誌同日配發研究亮點（Highlight），給予該研究高度評價。
野生與養殖哺乳動物攜帶高度多樣性的病原微生物，是新發病原體進一步傳播的重要樞紐。近期國內外多項研究表明，鼩鼱等嚙齒目及水貂等養殖食肉目動物具有攜帶亨尼帕病毒、冠狀病毒和禽流感病毒等人畜共患病毒的潛力，對動物源病毒的探索是“同一個健康”框架下預測預警新發傳染病的基礎（Zhang JT et al. (2024), Agüero et al. (2022), Lu L et al. (2021)）。
當前哺乳動物種類繁多，除豬等傳統家畜外，缺乏對其他動物尤其是養殖哺乳動物多地域、多類群、跨物種等不同維度內的綜合病毒組挖掘與跨尺度信息整合研究。因此，這些動物的病原生態學與流行病學數據存在較大空白，並成為新發傳染病疫情精準預測預報與公共衛生高效監測管理的重要瓶頸。
粟碩團隊與合作者對來自食肉目、偶蹄目等多種可用於皮毛、藥物等用途的哺乳動物進行了系統的病毒組研究。團隊采用前沿研究方法高分辨率表征了125種脊椎動物相關病毒基因組序列，極大豐富了病毒的多樣性和已知病毒的宿主譜。基於單樣本建庫策略，團隊解析了多種病毒在宿主個體水平上的混合感染情況，並進一步通過結合生態學地理分布、進化動力學及公共大數據等多學科交叉研究方法，推定出諾如病毒、蓋塔病毒等多種頻繁發生“宿主跳躍”的潛在“風險”病毒。同時，團隊還從空間聚類，動物類群、種群、組織等多維度揭示了潛在“風險”病毒的生態學與流行病學特征。
該成果將極大豐富動物源病毒遺傳本底數據，為人-動物-環境一體化下建立多維度的新發傳染病風險評估體系與新發傳染病預測預報奠定重要數據基礎。
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41586-024-07901-3
